Metagenomika je opredeljena kot neposredna genetska analiza genomov, ki jih vsebuje okoljski vzorec Področje se je sprva začelo s kloniranjem okoljske DNK, ki mu je sledil pregled funkcionalne ekspresije [1], in je bil nato hitro dopolnjen z neposrednim naključnim zaporedjem okoljske DNK [2, 3].
Kakšen je proces metagenomike?
Metagenomika vključuje pridobivanje DNK iz vseh mikroorganizmov znotraj skupnosti, ne da bi nujno identificirali vse vpletene vrste. Ko so geni sekvencirani in primerjani z identificiranimi zaporedji, je mogoče določiti funkcije teh genov.
Katera tehnika se uporablja v metagenomiki?
Vzorec mikrobne skupnosti se zbere iz morske vode, sedimenta, živali gostiteljice ali drugega morskega habitata. Zbrane celice nato liziramo in DNK ekstrahiramo iz njihovega lizata. Tehnika, ki omogoča metagenomiko, je zaporedje pušk, ki zaporedje naključne regije DNK na neciljan način.
Kateri so 3 koraki do študija metagenomije?
Koraki in proces metagenomike:
- Zbirka vzorcev:
- ekstrakcija DNK:
- Priprava vzorca:
- Vzorčna analiza:
Kako se izvaja funkcionalna metagenomika?
Funkcionalna metagenomika vključuje izolacijo DNK iz mikrobnih skupnosti za preučevanje funkcij kodiranih beljakovin. Vključuje kloniranje fragmentov DNK, izražanje genov v nadomestnem gostitelju in pregled za encimske aktivnosti.
