Vse aminokisline se nahajajo v α-vijačah, vendar sta glicin in prolin redka, saj destabilizirata α-vijačnico. Glicin je izvzet iz številnih steričnih omejitev ker nima β ogljika. … Proline pa je preveč tog.
Katere aminokisline ni v alfa spiralah?
Proline ne najdemo v alfa spiralni strukturi beljakovin, saj ima posebno ciklično strukturo (je iminokislina in ne aminokislina)m ta tip sekundarne strukture ima specifična širina in specifično število aminokislinskih ostankov / obrat. Zato se prolin obravnava kot alfa spiralni odklopnik.
Zakaj je glicin lomilec alfa vijačnice?
Prolin in glicin sta včasih znana kot "lomila vijačnice" ker motita pravilnost konformacije α spiralne hrbtenice; vendar imata oba nenavadne konformacijske sposobnosti in ju pogosto najdemo v zavojih.
Kje je glicin v alfa vijačnici?
Obstajajo trije položaji v motivu vijačnica–zavoj–vijačnica, ki so zelo ohranjeni. Alanin se običajno nahaja na položaju 5 znotraj prve α vijačnice; glicin se nahaja na položaju 9, prvi položaj zavoja; in bodisi valin ali izolevcin se običajno nahajata na položaju 15 znotraj druge α vijačnice.
Ali so ostanki glicina pretežno v alfa spiralah?
Glicin s svojimi številnimi možnimi konformacijami glavne verige redko najdemo tudi v vijačnicah. Če vemo, kako verjetno je, da se aminokislina pojavi v alfa vijačnici (tako imenovane nagnjenosti k vijačnici), je mogoče predvideti, kje se v zaporedju beljakovin pojavijo vijačnice.
