BigWig je format datoteke za prikaz zgoščenih, neprekinjenih podatkov v skladbi brskalnika genoma, ustvarjen s pretvorbo iz zapisa Wiggle (WIG). Format BigWig je opisan na spletnem mestu UCSC Genome Bioinformatics, vodnik za format datoteke Broad Institute pa ponuja dodatne informacije.
Kaj je format bigWig?
Format bigWig je za prikaz zgoščenih neprekinjenih podatkov, ki bodo prikazani kot graf Datoteke BigWig so prvotno ustvarjene iz datotek tipa WIG z uporabo programa UCSC wigToBigWig. Druga možnost je, da datoteke bigWig ustvarite iz datotek bedGraph s programom UCSC bedGraphToBigWig.
Kako uporabim datoteko bigWig?
Premaknite novo ustvarjeno datoteko bigWig (myBigWig.bw) na spletno dostopno http, https ali ftp lokacijo. Prilepite URL v obrazec za vnos skladbe po meri ali ustvarite sled po meri z uporabo ene vrstice. Prilepite vrstico skladbe po meri v besedilno polje na strani za upravljanje poti po meri.
Kaj je skladba bigWig?
bigWig Tracks so sledi za neprekinjene signale v celotnem genomu. Primerni so za prikaz različnih "surovih" rezultatov eksperimentov, kot so signali ChIP-Seq, signali RNA-Seq itd.
Kako ustvarim datoteko bigWig?
Obstaja več načinov za ustvarjanje velikih datotek. To običajno vključuje pretvorbo datoteke. bam v wiggle track (. wig) in nato pretvori wiggle track v binarni bigwig (.
