Večina STR je najdenih v nekodiranih regijah, medtem ko jih le približno 8% najdemo v kodirnih regijah (3). Poleg tega se njihova gostota med kromosomi nekoliko razlikuje. Pri ljudeh ima kromosom 19 največjo gostoto STR (4). V povprečju se en STR pojavi na 2000 bp v človeškem genomu (5).
Kje lahko najdem kratke tandemske ponovitve?
Ločitve DNKPo PCR amplificiranju se izmeri celotna dolžina amplikona STR, da se določi število ponovitev, prisotnih v vsakem alelu, ki ga najdemo v profilu DNK. Ta meritev dolžine se izvede z ločevanjem na podlagi velikosti, ki vključuje gel ali kapilarno elektroforezo (CE).
Kje so najdene tandemske ponovitve?
Tandemske ponovitve se pojavijo v DNK, ko se vzorec enega ali več nukleotidov ponovi in so ponovitve neposredno sosednje drug drugemu. Več beljakovinskih domen tvori tudi tandemske ponovitve znotraj svoje aminokislinske primarne strukture, kot so armadillo ponovitve.
Koliko je kratkih tandemskih ponovitev?
Leta 1997 je Zvezni preiskovalni urad (FBI) imenoval 13 avtosomne STR lokuse, da tvorijo jedro kombiniranega sistema indeksov DNK (CODIS), baze podatkov, sestavljene iz profilov prispevali zvezni, državni in lokalni forenzični laboratoriji.
Ali imajo vsi enake kratke tandemske ponovitve?
Preiskava teh nekodirajočih regij razkrije ponavljajoče se enote DNK, ki se med posamezniki razlikujejo po dolžini. Znanstveniki so ugotovili, da se ena posebna vrsta ponovitve, znana kot kratka tandemska ponovitev (STR), razmeroma enostavno izmeri in primerja med različnimi posamezniki
