BLAST je računalniški algoritem, ki je na voljo za uporabo na spletu na spletnem mestu Nacionalnega centra za biotehnološke informacije (NCBI) in na mnogih drugih mestih. BLAST lahko hitro uskladi in primerja poizvedbeno zaporedje DNK z bazo zaporedij, zaradi česar je kritično orodje v tekočih genomskih raziskavah.
Ali je BLAST primarna baza podatkov?
BLAST je najbolj razširjena programska oprema v raziskavah bioinformatike. Njegova glavna funkcija je primerjati zaporedje zanimanja, zaporedje poizvedb, z zaporedji v veliki zbirki podatkov BLAST, nato pa poroča o najboljših ujemanjih ali "zadetih", najdenih v bazi podatkov. Ta preprost program ima dve glavni aplikaciji.
Ali je NCBI baza podatkov?
NCBI hrani serijo baz podatkov, pomembnih za biotehnologijo in biomedicino in je pomemben vir za bioinformatična orodja in storitve. Glavne baze podatkov vključujejo GenBank za sekvence DNK in PubMed, bibliografsko bazo podatkov za biomedicinsko literaturo. Druge baze podatkov vključujejo bazo podatkov NCBI Epigenomics.
Ali je BLAST zaposlen samo v bazah podatkov NCBI?
BLAST je na voljo na spletu na spletnem mestu NCBI. Glede na zaporedje poizvedb in ciljne baze podatkov so na voljo različne vrste BLAST-ov.
Kako deluje baza podatkov BLAST?
Kako deluje BLAST? BLAST identificira homologna zaporedja z uporabo hevristične metode, ki na začetku najde kratka ujemanja med dvema zaporedjema; tako metoda ne upošteva celotnega zaporednega prostora. Po začetnem ujemanju poskuša BLAST začeti lokalne poravnave iz teh začetnih tekem.
